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人体β 防御素 3突变基因的构建及在大肠埃希菌中的融合表达

时间:2008-6-5 作者:不详 来源:不详 点击数:

【摘要】  目的 从人正常皮肤组织中提取β防御素3基因进行定点突变后在E.coli中融合表达。方法 从人正常皮肤组织中提取总RNA,经RTPCR扩增得到编码β防御素3成熟肽的cDNA序列,测序正确后,寻找合适的突变位点,设计含突变位点的引物,用PCR重叠延伸法对β防御素3成熟肽cDNA序列进行定点突变,将突变产物克隆至pUC18进行序列测定及在E.coli中融合表达。结果 测序结果表明,经RTPCR所得的β防御素3成熟肽序列与GeneBank中报道的编码人β防御素3成熟肽的cDNA序列完全一致。经过突变β防御素3成熟肽第29位谷氨酰胺密码子由CAG突变为精氨酸密码子CGA,其余核苷酸序列均未发生变化。将突变β防御素3基因在E.coli中诱导表达3~5h后可见突变β防御素3蛋白表达。结论 成功构建并表达了β防御素3突变体基因,为进一步对突变体进行真核表达、生物活性研究奠定了基础。

【关键词】  人体β防御素3; 定点突变; 基因克隆; 测序; 基因表达

  Construction and expression of a sitedirected mutant gene of human betadefensin3

  ABSTRACT  Objective  To extract the gene encoding human betadefensin3 (hBD3) from human foreskin tissue, make a sitedirected mutagensis and expression with the mutant gene in E.coli.  Methods  The total RNA extracted from human foreskin tissue and the sequence of cDNA encoding hBD3 was amplified by RTPCR. After sequencing, a pair of mutant primers was designed and sitedirected mutation was made by overlap extension PCR and then the mutant gene was expressed in E.coli.  Results  Sequencing analysis indicated that hBD3 DNA obtained by RTPCR was identical to the sequence reported in GenBank. After mutation, the code CAG for glutamine was changed into the code CGA for arginine at position 29. After induction for 3~5 hours, a new protein band appeared on SDSPAGE gel.  Conclusion  Mutant hBD3 (mhBD3) gene is constructed and expressed in E.coli BL21 successfully. It might provide a foundation for construction of eukaryotic expression vector and research of its biological activity.
   
  KEY WORDS  Human betadefensin3;  Sitedirected mutagensis;  Gene cloning;  Sequencing;  Gene expression

  抗菌肽是生物体产生的一类抗微生物的阳离子小分子多肽,是生物天然免疫的重要组成部分[1]。由于这些物质对许多致病菌都有抗菌作用,而且无致畸作用,无蓄积毒性,最为重要的是在机体内不易产生耐药性,因此有望开发为新型的抗生素,以解决日益严重的传统抗生素耐药性问题。   
  
  防御素(defensin)是近年来发现的一组富含半胱氨酸残基的抗菌肽,主要存在于上皮组织中,构成机体抵御病原微生物侵袭的第一道化学屏障[2]。人体β防御素3(human betadefensin3,hBD3)是新近被克隆出来的第三种人源性β防御素。它主要对革兰阳性菌如金葡菌具有高效、广谱的杀伤作用,对盐离子浓度不敏感,在生理盐浓度范围内不易产生溶血现象[3],具有研究和应用价值。为了进一步研究hBD3的结构与其抗菌活性间的关系,我们应用PCR重叠延伸法对hBD3成熟肽cDNA的分子结构进行改造,得到突变体hBD3(mutant human betadefensin3,mhBD3)并进行mhBD3的原核表达,以期得到抗菌谱更广、抗菌活性更稳定的抗菌肽。

  1  材料与方法

  1.1  材料
   
  总RNA提取试剂盒、一步法反转录试剂盒、Taq酶、pUC18质粒、T4DNA连接酶均购自华美公司;菌株DH5α、BL21为本实验室保存;DNA凝胶回收试剂盒、快速质粒小量提取试剂盒均购自上海生工公司;限制性内切酶、DL2000 DNA Marker购自大连TaKaRa公司;pGEX4T1购自Pharmacia公司;PCR引物由上海生工公司合成。

  1.2  方法

  1.2.1  细胞总RNA的提取  临床获取正常人新鲜包皮组织约150mg,用总RNA提取试剂盒提取总RNA,操作按说明书进行。

  1.2.2  RTPCR扩增人hBD3 cDNA  根据GenBank中编码hBD3成熟肽的45个氨基酸的cDNA序列设计一对引物,引物序列如下:上游引物(a):5′GGGAATTCGGAATCATAAACAC3′,在引物5′端加上EcoRI酶切位点,并设计GG两个保护碱基;下游引物(b)5′GGGTCGACTTATTTCTTTCTTC3′在引物5′端加上SalI酶切位点,并设计GG两个保护碱基。以提取的总RNA为模板,a和b为引物进行RTPCR。RTPCR按试剂盒说明书进行,取10μl RTPCR扩增产物于2%琼脂糖凝胶电泳,在凝胶成像系统下观察并记录结果。

  1.2.3  hBD3基因的克隆及序列测定  将PCR扩增产物和pUC18用EcoRI和SalI双酶切,回收纯化后16℃连接过夜,转化于用常规CaCl2法制备的感受态E.coli DH5α中,经蓝白筛选挑取白色菌落,提取质粒,双酶切及针对pUC18多克隆位点设计如下引物进行PCR鉴定。上游引物:5′GCCAGGGTTTTCCCAGTC3′,下游引物:5′GCGGATAACAATTTCACA3′,并送上海生工测序。

  1.2.4  hBD3基因的突变  根据hBD3的分子结构,找出合适的突变位点,设计一对突变引物,引物序列如下:突变上游引物(c):5′GAGGAACGAATCGGCAAGTGCT3′,突变下游引物(d):5′CGAGCACTTGCCGATTCGTTCC3′。应用PCR重叠延伸法[4]对hBD3基因进行定点突变(Fig.1)。①片段AD的获得:用引物a和d进行PCR反应,10×缓冲液5μl,MgCl2 3μl,dNTPs 4μl,引物a和d各1μl,模板1μl,无菌双蒸水34μl,Taq酶1μl,共50μl反应体系。94℃预变性5min,94℃ 30s,52℃ 30s,72℃ 30s,共30个循环,72℃延伸7min,取10μl扩增产物于2%琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像系统下观察结果;②片段CB的获得:用引物c和b进行PCR反应,反应条件同上;③PCR重叠延伸:用凝胶回收后的AD和CB作为模板,用引物a和b进行PCR反应,10×缓冲液5μl,MgCl2 3μl,dNTPs 4μl,引物a和b各1μl,模板AD和CB各5μl,无菌双蒸水25μl,Taq酶1μl,共50μl反应体系。94℃变性5min,72℃退火并延伸7min,然后94℃预变性5min,94℃ 30s,52℃ 30s,72℃ 30s,共27个循环,72℃延伸7min,取10μl扩增产物AB于2%琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像系统下观察结果。

  1.2.5  mhBD3基因的克隆及序列测定  将PCR重叠延伸产物和pUC18用EcoRI和SalI双酶切,回收纯化后在T4DNA连接酶作用下16℃连接过夜。常规CaCl2法制备感受态E.coli DH5α,取5μl连接产物转化于200μl感受态细胞中。在含IPTG、Xgal的氨苄西林培养基上挑取白色菌落,用上海生工的小量质粒快速抽提试剂盒抽提质粒,用EcoRI和SalI双酶切及用针对pUC18多克隆位点的引物进行PCR鉴定,重组质粒送上海生工公司测序。

  1.2.6  mhBD3基因的表达  用EcoRI和SalI双酶切含有mhBD3基因片段的重组质粒pUC18mhBD3和表达载体pGEX4T1回收纯化后16℃连接过夜,转化于感受态E.coli BL21中,双酶切、PCR筛选阳性克隆。挑取单个阳性克隆接种于3ml含氨苄西林(0.005%)的LB培养基中过夜。次日按1∶100接种于含氨苄西林(0.005%)新鲜的LB培养基中,37℃培养3h,加入IPTG终浓度为0.5mmol/L,诱导表达3~5h,取2.0ml菌液,5000r/min,离心5min,收集菌体。用15μl H2O重悬菌体,加入等体积的2×上样缓冲液(100mmol/L TrisCl pH6.8,200mmol/L 2巯基乙醇,20%甘油,4% SDS,0.1%溴酚兰)混匀,100℃煮沸3~5min,离心取上清20μl进行堆积胶浓度为5%,分离胶浓度为15%的SDSPAGE电泳,用考马斯亮蓝G250染色,观察mhBD3基因的表达结果。

2  结果

  2.1  RTPCR扩增hBD3 cDNA
   
  RTPCR扩增出约150bp左右的特异条带,和预期的hBD3 cDNA大小一致(Fig.2)。

  2.2  hBD3基因序列测定
   
  所获hBD3成熟肽的cDNA序列与GenBank中报道的序列相一致(图略)。

  2.3  hBD3基因的突变
   
  经前两次PCR得到产物AD和CB分别约为98和60bp,再经PCR重叠延伸得到产物约为154bp(Fig.3)。

  2.4  重组质粒的筛选及鉴定
   
  重组质粒pUC18mhBD3经EcoRI+SalI双酶切后,可见约为138bp的小片段。经PCR扩增后可见克隆重组体扩增的片段约为270bp的目的片段,pUC18扩增的片段约140bp,说明在pUC18中插入约为130bp的片段(Fig.4)。

  2.5  mhBD3基因的序列分析序列分析结果表明,hBD3成熟肽mRNA第29位密码子CAG突变为CGA, 氨基酸相应由谷氨酰胺突变为精氨酸,其他核苷酸序列均未发现改变(图略)。

  2.6  mhBD3基因在大肠埃希菌中的表达
   
  pGEX4T1为一种GST融合表达载体,含GST基因,编码25.8ku的谷胱甘肽巯基转移酶(glitathione Stransferse)。在IPTG的诱导下以GST融合蛋白的形式表达目的基因。GST与多克隆位点之间有凝血酶酶切位点,目的蛋白可用凝血酶从表达的融合蛋白上切割下来。重组的表达质粒pGEX4T1mhBD3转化E.coli BL21,阳性转化子经IPTG诱导,在Ptac启动子启动下表达。经SDSPAGE电泳,用考马斯亮蓝G250染色结果,在约30.8ku处有一条明显的条带,GST与mhBD3基因融合表达后融合蛋白约为30.8ku。

  3  讨论
   
  防御素是人体内主要的抗菌肽,包括α防御素和β防御素两种[5]。其中β防御素主要来源于皮肤、呼吸道等上皮组织,目前已发现4种人体β防御素(human betadefensin,hBD)。hBD1是于1995年由Bensch等[6]从人血滤液中分离纯化获得;hBD2是Harder等[7]于1997年从人牛皮癣组织中分离纯化得到。2001年Harder等[3]采用金葡菌亲和柱从人牛皮癣组织中分离纯化得到了hBD3。hBD4也于2001年发现,只是在感染时选择性的表达于某些组织中。hBD1和hBD2主要对革兰阴性菌如大肠埃希菌、铜绿假单胞菌等有很强的抗菌活性,但对现在耐药最严重的并引起皮肤脓肿、心内膜炎等一系列临床病症的革兰阳性菌则表现出较弱的抗菌活性[8]。hBD3不同于前两者,它在很小的剂量范围内就表现出对金葡菌、耐万古霉素的肠球菌、化脓链球菌等革兰阳性菌的抗菌活性[3]。hBD3独具的这一特性与其结构有关。研究表明,与hBD1和hBD2相比较,hBD3分子可形成两亲性二聚体结构,而hBD1和hBD2分子均为单体结构。此外,hBD3分子所带的净正电荷(+11)高于hBD1(+5)和hBD2(+6)所带的净正电荷[9]。
   
  hBD3分子由67个氨基酸组成,其中含22个氨基酸的信号肽和45个氨基酸的成熟肽,成熟肽分子中含有6个半胱氨酸残基,形成3对二硫键,分子内含有7个精氨酸和6个赖氨酸残基。Hoover等[10]在研究hBD3结构与活性的关系时,根据hBD3结构序列合成了一系列短肽,这些短肽几种是hBD3序列的一部分,几种是对原hBD3分子中的氨基酸进行替换,它们大小不同,二硫键配对方式不同,所带电荷数不同。通过对这几种hBD3衍生物的抗菌活性实验,Hoover等发现hBD3的抗菌活性与其N末端序列、分子中所含的精氨酸残基和芳香族氨基酸等因素密切相关。为了进一步研究hBD3的结构与其杀菌活性的关系,开拓其在抗菌领域的应用前景,我们采用PCR重叠延伸法,使hBD3成熟肽分子中的29位谷氨酰胺密码子CAG突变为精氨酸密码子CGA,增加了分子中的精氨酸数,使其分子净正电荷数由突变前+11价增加为突变后+12价,并成功构建了突变体的重组克隆和在E.coliBL21中的表达,为mhBD3的真核表达、抗菌活性的研究奠定了基础。

【参考文献】
    [1] 查向东,徐康森,刘兢. 阳离子抗菌肽研究进展[J]. 中国药理学通报,2003,19(7):735

  [2] Ganz T, Lehrer R I. Defensins [J]. Pharmacol Ther,1995,66(2):191

  [3] Harder J, Bartel J, Christophers E, et al. Isolation and characterization of human betadefensin3, a novel human inducible peptide antibiotic [J]. Bio Chem,2001,276(8):5707

  [4] 萨姆布鲁克J, 拉塞尔 D W. 分子克隆实验指南[M]. 北京:科学出版社,2002:1109

  [5] Fellermann K, Stange E F. Defensinsinnate immunity at the epithelial frontier [J]. Eur J Gastroenterol Hepatol,2001,13(7):771

  [6] Bensch K W, Raida M, Magert H J, et al. hBD1: A novel betadefensin from human plasma [J]. FEBS LETT,1995,368(2):331

  [7] Harder J, Bartel J, Christophers E, et al. A peptide antibiotic from human skin [J]. Nature,1997,387(2):861

  [8] Dinulos J G, Mentele L, Fredericks L P, et al. Keratinocyte expression of human beta defensin 2 following bacterial infection: role in cutaneous host defense [J]. Clin Diagn Lab Immunol,2003,10(1):161

  [9] Schibli D J, Hunter H N, Aseyev V, et al. The solution structures of the human βdefensin lead to a better understanding of the potent bactericidal activity of hBD3 against Staphylococues aureus [J]. Bio Chem,2002,277(10):8279

  [10] Hoover D M, Wu Z B, Tucker K, et al. Antimicrobial characterization of human βdefensin 3 derivatives [J]. Antimicrob Agents Chemother,2003,47(9):2804

 

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