微生物采油最早在1926年由美国学者Bachioan提出将细菌注入地层来提高原油采收率。20世纪40年代Zobell报道了加拿大艾伯塔省的阿萨巴斯卡焦油砂中用细菌释放出油，此后引起人们很大的兴趣。经过70多年研究，许多国家研究微生物采油已经从实验室走向现场试验。利用微生物及其代谢产物来增加石油的产量，这种技术被称为微生物强化采油技术，它是近一二十年快速发展的新技术。微生物采油是指将地面分离培养的微生物菌液和营养液注入油层，或单纯注入营养液剂或油层内微生物，使其在油层内生长繁殖，产生有利于提高采收率的代谢产物，以提高油田采收率的采油方法。这种方法主要应用在三次采油中。

　　微生物处理地层的方法，基本原理主要可分为以下两大类：第一类是采用在地表用矿场发酵装置制备的微生物生命活动物质（代谢产物）。第二类是使微生物在地层中发育，得到代谢产物。

　　微生物提高采收率的原理包括：

　　(1)微生物在油层中增殖，形成生物量。特别是产黏液的细菌，当密集成团时，可选择性或非选择性地堵塞地层中的孔道，从而改变流动方向，扩大扫油面积。由于菌体通常黏附在岩石表面，改变岩石表面的润湿性，从而将岩石上附着的油膜替代下来。

　　(2)能降解烃类的微生物，可将高分子的石油烃类降解为低分子的烃类，从而降低石油的黏度和凝点，增加原油的流动性。

　　(3)微生物的代谢产物有的可产生气体，如CO2，CH4，H2等，使油层压力增加，从而提高产能。CO2，CH4等在一定压力条件下可以部分溶解在原油中，从而使原油体积膨胀，黏度降低，大大提高采收率。

　　(4)就地发酵产生的有机酸和气体使井筒周围得到清洗。

　　(5)微生物代谢产物有的可产生表面活性剂，从而降低水—岩石—原油体系的界面张力，提高洗油效率。

　　(6)微生物的代谢产物生成的聚合物，如黄孢胶，可用于驱油。