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基因组shotgun测序

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所在地: 北京
有效期至: 长期有效
最后更新: 2011-03-29 21:14
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公司基本资料信息
详细说明
 

我们运用鸟枪法测序的方法对大质粒DNA,如BAC, Fosmid和Cosmid,以及全基因组DNA进行测序。 同时,在每一个项目中,我们的项目经理会对测定全程进行跟踪,并及时的向客户提供进展情况。
 

 
  服务项目包括:
 
 
 
  • shotgun文库构建
    • Shotgun文库质量控制;
    • 文库筛选;
    • 亚克隆质粒DNA抽提;
    • 用3730xl对质粒进行测序;
    • 序列拼装;
    • 设计引物,进行Gap closure;
    • 可以达到对整个基因组99.9%y以上的覆盖率;
    • 提供DNA模板和进行生物学基因注释。
 
  序列拼装:
 
 
 

我们拥有良好的生物信息学和序列拼装的团体,能高效、正确的完成序列拼装这一工作。我们除了运用如Phred , Phrap和Consed拼装软件外,还运用curation相互互补,尽可能的减少错拼的产生。 在运用常规的prime-walking或是直接PCR测序外,我们还采用pair-end的测序方法,最大限度的来解决重复序列拼装的所产生的错拼的问题。同时,我们内部的负责生物信息的伙伴们也会为我们提供精确的,有用的数据,更好的完成序列拼装这一工作。最后,为您呈上一份完整的序列文本和其他相应的文件、资料。
 

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