公司建有制剂、化学合成和生物技术、抗生素发酵等五大生产基地，占地97万平方米，公司的全自动生产线和其他主要生产设备及检测仪器均购自于世界主要专业制药设备制造商。原料药生产包括发酵、化学合成、生物化学合成、基因工程、冻干及溶媒结晶等多种形式;制剂生产具有口服固体制剂片剂、胶囊剂、颗粒剂，注射剂粉针剂、冻干粉针剂、小容量注射剂，以及外用制剂乳膏剂、喷雾剂、滴眼剂等完整合理的药物剂型。
齐鲁制药二期工程总投资2亿元，建筑面积5.8万平方米，将新建原料冻干生产线、综合制剂大楼、口服固体制剂大楼及新增粉针生产线等项目。投产后预计形成新增原料产能55吨、制剂总产能50亿支(粒、片、袋)的生产规模，年新增销售收入15亿元，新增利税4.5亿元。按照济南高新区党工委、管委会关于重点项目进度的要求，该项目一季度末基础施工已完毕，二季度末厂房建至2—3层，预计三季度末2个小厂房封顶，大厂房建至5层，四季度末2个小厂房进行内外装修，大厂房封顶并主体验收。